Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms