Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CartptP56388 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CartptP56388 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CartptP56388 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CartptP56388 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CartptP56388 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CartptP56388 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CartptP56388 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CartptP56388 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CartptP56388 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CartptP56388 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CartptP56388 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CartptP56388 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CartptP56388 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CartptP56388 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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CartptP56388 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CartptP56388 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms