Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfbP49766 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfbP49766 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfbP49766 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfbP49766 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfbP49766 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfbP49766 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VegfbP49766 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfbP49766 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms