Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PtpreP49446 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PtpreP49446 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PtpreP49446 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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