Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc3P33622 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms