Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc6a9P28571 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms