Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms