Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U2af2P26369 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms