Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P20040 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P20040 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P20040 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms