Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhoP15409 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhoP15409 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhoP15409 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhoP15409 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhoP15409 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhoP15409 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RhoP15409 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhoP15409 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhoP15409 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhoP15409 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhoP15409 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RhoP15409 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RhoP15409 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RhoP15409 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RhoP15409 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RhoP15409 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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