Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DmdP11531 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DmdP11531 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DmdP11531 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DmdP11531 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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DmdP11531 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DmdP11531 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DmdP11531 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DmdP11531 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DmdP11531 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DmdP11531 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DmdP11531 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DmdP11531 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DmdP11531 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms