Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms