Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
UbbP0CG49 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms