Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01837 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01837 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01837 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms