Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01748 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01748 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01748 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms