Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms