Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AurkcO88445 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms