Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms