Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms