Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20834J3QM72 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20834J3QM72 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20834J3QM72 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20834J3QM72 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20834J3QM72 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20834J3QM72 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20834J3QM72 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20834J3QM72 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20834J3QM72 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms