Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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