Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm5861F6VCN9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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