Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms