Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms