Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms