Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms