Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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