Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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