Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav3Q9R0C8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms