Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms