Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms