Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms