Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms