Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms