Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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