Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms