Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc89Q9DA73 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc89Q9DA73 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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