Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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