Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms