Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms