Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Ubqln4Q99NB8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Ubqln4Q99NB8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Ubqln4Q99NB8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Ubqln4Q99NB8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Ubqln4Q99NB8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln4Q99NB8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Ubqln4Q99NB8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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