Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl3Q99N95 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl3Q99N95 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl3Q99N95 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms