Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms