Protein–RNA interactions for Protein: Q99J64

Rbm43, RNA-binding protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm43Q99J64 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rbm43Q99J64 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm43Q99J64 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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