Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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