Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms