Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms