Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx8Q8CFD4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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