Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms