Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms